Maraton získal pro rok 2020 status mistrovství Česka, jelikož se původní závod v Praze nekonal. Termín konání maratonu na jihu Čech byl 24. října. Kvůli pandemii pořadatelé závod odložili na 21. listopadu, ale ani v tomto termínu je již jisté, že se hromadné akce nebudou konat.
Proto pořadatelé spolu se svazem rozhodli o odložení závodu až na podzim 2021. Nový předběžný termín Třeboňského maratonu je sobota 16. říjen 2021. Start závodu je v plánu na 10:45 z třeboňského Masarykova náměstí. V rámci akce se poběží i půlmaraton a desítka.
Trasa zůstává v platnosti. Tedy Třeboň – Branná – směr Suchdol nad Lužnicí a zpět.